DNASTAR培訓(xùn)課程班

課程簡介：

DNASTAR培訓(xùn)

DNASTAR是完整的序列分析軟件，用于分子生物學(xué)研究、蛋白質(zhì)分析、基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究。

內(nèi)容及介紹如下：

1、Adding sequence files for alignment in MegAlign Pro

介紹在執(zhí)行比對之前添加和組織序列數(shù)據(jù)的不同方法，了解如何將不同的核苷酸和蛋白質(zhì)序列加載到DNASTAR的MegAlign Pro應(yīng)用程序中。

2、Choosing the best assembly strategy for your genomic sequencing data webinar

深入探討了基因組測序數(shù)據(jù)的不同組裝策略。DNASTAR高級(jí)產(chǎn)品經(jīng)理Matthew Keyser幫助您確定何時(shí)使用不同的基于參考的和從頭開始的方法，以及如何執(zhí)行各種拋光和校正技術(shù)來關(guān)閉基因組。組裝后，了解如何關(guān)閉缺口，并準(zhǔn)備您的基因組序列進(jìn)行注釋和下游分析。

3、Coloring a structure in Protean 3D according to features or properties

展示如何將表面應(yīng)用于DNASTAR的Protean 3D軟件中的分子結(jié)構(gòu)，如何為選定的特征著色，以及如何根據(jù)選定的生物物理或免疫遺傳特性為整個(gè)結(jié)構(gòu)上色。

4、De novo assembly and analysis of Sanger_ABI data

了解如何快速輕松地組裝Sanger/ABI測序數(shù)據(jù)并進(jìn)行下游分析。本視頻向您展示如何完成裝配設(shè)置，可視化，裝配編輯和修剪，并使用SeqMan Ultra BLAST搜索。

5、Exome Analysis Tutorial

了解如何在Lasergene Genomics中以無與倫比的輕松和速度將來自所有主要NGS平臺(tái)的外顯子組重測序數(shù)據(jù)與參考序列進(jìn)行比對。全面的組裝后分析選項(xiàng)使識(shí)別和比較遺傳變異以及結(jié)構(gòu)和非編碼變異變得容易。先進(jìn)的基因過濾提供了確定變異對每個(gè)基因造成的破壞程度的能力。在本教程中，我們將向您展示完成NGS外顯子組分析所需的一切。

6、Fast ways to do multiple sequence alignment in MegAlign Pro

DNASTAR高級(jí)軟件工程師Andy Thomas展示了使用MegAlign Pro應(yīng)用程序運(yùn)行多序列比對的兩種非常快速的方法。MegAlign Pro是Lasergene分子生物學(xué)軟件包的一部分。

7、Gap closure after de novo assembly using SeqMan Ultra

了解如何在完成重新組裝后完成間隙閉合。本視頻將根據(jù)您的具體數(shù)據(jù)介紹三種不同的方法。

8、Get to know SeqMan Ultra
了解我們用于Sanger序列組裝和分析的最新應(yīng)用程序SeqMan Ultra。憑借豐富的分析和可視化工具以及改進(jìn)的算法，實(shí)現(xiàn)更快的組裝和更高的容量，看看為什么SeqMan Ultra是序列組裝和分析的新面孔。

9、How can DNASTAR's protein tools help you Webinar

展示如何使用綜合蛋白質(zhì)工具來研究和建模新型冠狀病毒（2019-nCov）上的尖峰蛋白。作為演示的一部分，我們將向您展示如何將這些工具應(yīng)用于您自己的數(shù)據(jù)，教您：
.分析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)，進(jìn)行結(jié)構(gòu)比對，并為發(fā)表準(zhǔn)備結(jié)構(gòu)
.分析生物物理特性,預(yù)測蛋白質(zhì)功能
.使用NovaFold蛋白質(zhì)建模增強(qiáng)實(shí)驗(yàn)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)或從序列數(shù)據(jù)預(yù)測結(jié)構(gòu)

10、Lasergene Genomics overview

Lasergene Genomics提供轉(zhuǎn)錄組和基因組測序數(shù)據(jù)的組裝、校準(zhǔn)和分析所需的一切，所有這些都在一個(gè)集成的包中。我們支持傳統(tǒng)和下一代測序分析，以適應(yīng)各種工作流程，因此您可以使用一個(gè)軟件包進(jìn)行所有的NGS分析。

11、Learn SeqBuilder Pro’s annotation, primer, batch cloning and clone verification workflows

介紹了有關(guān)SeqBuilder Pro許多有用的工作流程的詳細(xì)信息。

12、Predict the 3D Structure of a Protein Using NovaFold AI

DNASTAR的NovaFold AI應(yīng)用程序使用AlphaFold 2算法，根據(jù)蛋白質(zhì)序列預(yù)測蛋白質(zhì)的3D結(jié)構(gòu)。

13、Quick assembly setup in SeqMan Ultra

了解如何使用SeqMan Ultra和SeqMan NGen為Sanger/ABI數(shù)據(jù)快速設(shè)置和運(yùn)行程序集。如果使用的是單樣本數(shù)據(jù)，則可以快速添加序列并運(yùn)行程序集，而無需指定程序集參數(shù)。

14、Quickly convert sequence files to a different file type

展示了如何使用SeqNinja應(yīng)用程序在幾秒鐘內(nèi)將一個(gè)或多個(gè)序列文件從一種文件類型轉(zhuǎn)換為另一種。SeqNinja包含在所有三個(gè)Lasergene軟件包中：分子生物學(xué)、蛋白質(zhì)和基因組學(xué)。

15、Reference-guided Sanger sequence assembly in SeqMan Ultra 17.0 and 17.1

展示了如何在SeqMan Ultra 17.0和17.1中進(jìn)行參考引導(dǎo)的Sanger序列組裝和分析。SeqMan Ultra是DNASTAR Lasergene軟件的一個(gè)組件。了解如何將多個(gè)樣本的Sanger/ABI數(shù)據(jù)與參考序列或基因組進(jìn)行比對。使用SeqMan Ultra快速輕松地比較樣本，調(diào)查痕量和質(zhì)量數(shù)據(jù)，并分析SNPs。

16、Reference-guided Sanger sequence assembly in SeqMan Ultra 17.2 and later

展示了如何在SeqMan Ultra 中進(jìn)行參考引導(dǎo)的Sanger序列組裝和分析。SeqMan Ultra是DNASTAR的Lasergene軟件的一個(gè)組件。查看如何將Sanger/ABI數(shù)據(jù)與參考序列對齊。使用SeqMan Ultra快速輕松地比較樣本，調(diào)查痕量和質(zhì)量數(shù)據(jù)，并分析SNPs。

17、RNA-Seq Analysis using Lasergene Genomics Webinar

NA-Seq數(shù)據(jù)分析對許多研究人員來說是一個(gè)挑戰(zhàn)，因?yàn)檫@項(xiàng)技術(shù)的應(yīng)用非常廣泛。本視頻將演示如何使用Lasergene Genomics來獲取RNA序列數(shù)據(jù)的全貌。

18、RNA-Seq Project Set Up in SeqMan NGen

了解如何在SeqMan NGen (Lasergene Genomics的一部分)中使用復(fù)制建立RNA-Seq項(xiàng)目。

19、Supported File Types in MegAlign Pro

了解DNASTAR的MegAlign Pro應(yīng)用程序支持的不同文件類型，包括fasta文件和GenBank文件。

20、Variant Annotation Database Tutorial

逐步展示了Lasergene針對人類樣本變體注釋的工作流程。首先在SeqMan NGen中進(jìn)行序列組裝、變體檢測和樣本自動(dòng)注釋，然后在ArrayStar中進(jìn)行變體過濾和分析。

21、What's New in SeqMan Ultra 17.2

展示了Lasergene的SeqMan Ultra 17.2中的許多新功能，包括Sanger序列組裝，ABI序列修剪，導(dǎo)出對齊圖像等等。

練習(xí)

答疑